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La grande forêt équatoriale africaine a beau constituer la deuxième plus vaste réserve de biodiversité de la planète, elle n'en reste pas moins mal connue. Accompagné de nombreux scientifiques, Nicolas Hulot la traverse de bout en bout, reliant le Gabon au Nord-Congo. Des paysages de rêve se déroulent autour des rapides de l'Ogoué, un vaste fleuve que les explorateurs survolent avant de se poser aux abords des locaux d'une mission scientifique. Tandis que les uns, en laboratoire, cherchent à isoler les virus inconnus tapis dans la jungle africaine, d'autres observent le fourmillement d'insectes rares et dangereux. Ailleurs, ce sont des gravures rupestres qui retiennent l'oeil.